实验室实行学校领导下的主任负责制，设立学术委员会进行学术指导。实验室主任以及研究团队负责人定期讨论、检查、协调日常科研及管理工作。实验室由综合管理办公室和科研创新平合组成，科研创新平台中根据实验室的四个研究方向相应的设立了四个研究平合，分别为煤炭资源精细勘察与地质保障平合、绿色开采基础理论与技术研究平台、生态修复与固废处置技术研究平台和安全开采与灾害防治理论与技术平台。

   为了鼓励研究人员长期从事基础研究，克服目前教育及科技界对科研人员每年一考核的缺点，新疆煤炭资源绿色开采教育部重点实验室实行按研究团队考核的机制，即实验室每年只对研究团队进行考核，团队完成整体研究任务并取得相应成果即为合格。这样兼顾了实验室的整体研究目标和科研人员的个人实际情况，使研究团队及科研人员能安心的进行长期规划和潜心的围绕稳定的研究方向钻研。

   由本领域著名专家组成学术委员会，对实验室进行学术指导。审议实验室的目标、任务和研究方向，指导实验室的学科建设、科学研究与人才培养，审议实验室的重大学术活动、年度工作，审批开放研究课题，检查实验室的运行情况等。委员会人员构成如下。

   主任委员： 

   彭苏萍：中国工程院院士，中国矿业大学的“国家重大人才工程入选者”特聘教授，博士生导师，北京市煤炭学会常务理事，北京市石油学会理事，煤炭资源与安全开采国家重点实验室主任，新疆工程学院名誉校长等。

    副主任委员：

   张吉雄 教授、博导，中国矿业大学，国家杰青中国矿业大学副校长、中国矿业大学矿业工程学院院长、煤炭资源与安全开采国家重点实验室副主任，享受国务院政府特殊津贴专家、获国家万人计划科技创新领军人才、科技部中青年科技创新领军人才、教育部新世纪优秀人才、江苏特聘教授、江苏省有突出贡献中青年专家、江苏省“333工程”中青年领军人才及江苏省高校科技创新团队带头人等多项学术荣誉。

   李树刚，教授、博导，原西安科技大学副校长，百千万人才工程国家级人选、国家有突出贡献中青年专家、享受国务院政府特殊津贴专家。现任国务院学位委员会安全科学与工程学科评议组成员，中国职业安全健康协会常务理事，国家安全生产应急专家组成员，教育部高等学校安全工程教学指导委员会委员。

    委员:

   冯国瑞 教授、博导，山西能源学院，现任山西能源学院党委副书记、院长，国家杰出青年科学基金获得者、国家优秀青年科学基金获得者、国家“万人计划”科技创新领军人才。

   鞠杨 教授、博导，中国矿业大学（北京），国家杰青，长江学者，现任煤炭资源与安全开采国家重点实验室副主任、北京市岩石混凝土破坏力学重点实验室常务副主任、岩石力学与分形研究所副所长，国家自然科学基金委员会创新研究群体首席科学家、十四五国家重点研发计划项目负责人。获国家杰出青年基金、教育部长江学者特聘教授、国家万人计划科技领军人才等荣誉或称号。

   张建国 正高级工程师，中国平煤神马集团，曾任中国平煤神马集团副总工程师、总工程师，本公司副总经理。现任中国平煤神马集团党委常委、常务副总经理，本公司董事。

   程卫民 教授、博导，山东科技大学，现任山东科技大学矿业与安全工程学院院长、山东省政协委员、民盟泰安市委副主委。

   柏建彪 教授、博导，中国矿业大学，全国百篇优博获得者，天池特聘

   陈绍杰 教授、博导，山东科技大学，长江学者，现为山东科技大学采矿工程学科青年带头人，现任山东科技大学科技处处长、能源与矿业工程学院院长。

   黄艳利 教授、博导，中国矿业大学，万人计划领军人才，国家优青，现任中国矿业大学矿业工程学院院长。

   仲晓星 教授、博导，中国矿业大学，现任中国矿业大学研究生院副院长、煤炭资源与安全开采国家重点实验室副主任、中国矿山安全学会矿井通风专业委员会秘书长，曾任中国矿业大学安全工程学院副院长。入选国家重大人才工程计划科技创新领军人才、青年拔尖人才以及教育部新世纪优秀人才等人才工程。

   浦  海 教授、博导，中国矿业大学，国家优青，天池特聘，国际岩石力学学会（ISRM）会员，中国岩石力学与工程学会地下工程分会理事。

   陈  结 教授、博导，重庆大学，国家优青，现任重庆大学技术转移研究院院长。

   杨胜利 教授、博导，中国矿业大学（北京），青年长江学者，现任中国矿业大学（北京）能源与矿业学院院长，兼任中国岩石力学与工程学会采矿岩石力学分会常务理事、中国煤炭工业煤矿智能化与新技术专家委员会委员、中国煤炭学会青年工作委员会委员、中国煤炭学会开采专业委员会委员等职务。

   王文峰 教授、博导，新疆大学 现任新疆大学地质与矿业工程学院党委书记。

   刘清涛 正高级工程师，中煤集团新疆能源公司，中煤集团新疆能源公司总工程师。

   刘福明 正高级工程师，新疆天池能源有限责任公司，现任天池能源刘福明矿长。